Двустворчатые моллюски также содержатся в аквариумах, например, перловица обыкновенная и дрейссена речная. Их полезность выражается в том, что выполняют роль живых биофильтров: прогоняя через себя воду, они задерживают муть и мельчайшие организмы (одноклеточные водоросли, жгутиковых и др.). В зависимости от разновидности и размеров один моллюск способен профильтровать в сутки от 5 до 50 л воды. А есть некоторые виды рыб (например, горчаки), для которых двустворчатые моллюски необходимы для успешного размножения, ведь в мантийную полость моллюсков они откладывают икру.
Большая часть двустворчатых моллюсков, взятых из отечественных водоемов, не живут при температуре выше 20 градусов Цельсия, поэтому могут существовать только в холодноводных аквариумах. А вот тропические виды неплохо подходят для тепловодных аквариумов.
В период размножения двустворчатые моллюски могут представлять определенную опасность в аквариуме из-за их личинок (глохидий). Глохидии в период своего развития, в течении пары месяцев паразитируют на жабрах, коже, и в тканях рыб, прикрепляясь к ним при помощи клейкого вещества.
Многие аквариумисты считают, что содержание двустворчатых моллюсков в аквариуме приносит больше забот, чем удовольствия, тем более при отсутствии у человека большого опыта. Двустворчатые моллюски дышат растворенным в воде кислородом, что причиняет неудобства рыбкам. Обитание двустворчатых моллюсков в грунте чревато порчей корней водорослей.